ACTG 315 Long-Term Viral Dynamics

ACTG 315 Long-Term Viral Dynamics for Semiparametric Nonlinear Mixed-Effects Models

            Obs. No.     Patid     Day        RNA 
           1           1         -35       15000
           2           1          -7       14000
           3           1           0       23000
           4           1           2       23000
           5           1           7        3400
           6           1           8        1200
           7           1          16         950
           8           1          22         380
           9           1          29         440
          10           1          57         130
          11           1          91          50
          12           1         127          50
          13           2         -34        1200
          14           2          -7        2100
          15           2           0        6200
          16           2           2        2400
          17           2           7          50
          18           2           9          50
          19           2          14          50
          20           2          21          50
          21           2          29          50
          22           2          56          50
          23           2          85          50
          24           2         167          50
          25           2         343          50
          32           3         -34       54000
          33           3          -7       52000
          34           3           0       59000
          35           3           7       13000
          36           3           9        7000
          37           3          14        1700
          38           3          21         800
          39           3          28         600
          40           3          56         270
          41           3          84        1900
          42           3         166       16000
          43           3         336       30000
          47           4         -40         760
          48           4          -7        6200
          49           4           0        8500
          50           4           2        9000
          51           4           7         410
          52           4          10         410
          53           4          14         420
          54           4          22         440
          55           4          28         160
          56           4          56          50
          57           4          86         550
          58           4         169          50
          59           4         337          50
          60           5         -35        4000
          61           5          -7      310000
          62           5           0      260000
          63           5           3       25000
          64           5           8        7800
          65           5           9        2900
          66           5          14        2400
          67           5          21         340
          68           5          28          50
          69           5          56          50
          70           5          84          50
          71           5         168          50
          72           5         344          50
          73           6          -7       48000
          74           6           0       32000
          75           6           2       65000
          76           6           6        5500
          77           6           9        3300
          78           6          13        2500
          79           6          27         540
          80           6          51         820
          81           6          84         860
          82           6         176          50
          83           6         337          50
          84           7         -35       90000
          85           7          -7      120000
          86           7           0      150000
          87           7           7      180000
          88           7          10       88000
          89           7          14       19000
          90           7          21       18000
          91           7          28       12000
          92           7          56        1800
          93           7          84         740
          94           7         168      170000
          95           7         265       78000
          96           8         -21       86000
          97           8          -7       64000
          98           8           0       87000
          99           8           2       77000
         100           8           7        7500
         101           8          10        4300
         102           8          14        3100
         103           8          21        1400
         104           8          25        1700
         105           8          56        2000
         106           8          84        1300
         107           8         168         400
         108           8         337          50
         109           9         -34       80000
         110           9          -7       37000
         111           9           0       67000
         112           9           7        6500
         113           9           9        8900
         114           9          14        1800
         115           9          21         660
         116           9          28         920
         117           9          56       17000
         118           9          84        4400
         119           9         166        9100
         120           9         336       83000
         121          10         -33      148000
         122          10          -7      260000
         123          10           0      210000
         124          10           7       27000
         125          10           9       20000
         126          10          14        7600
         127          10          20       11000
         128          10          28        3700
         129          10          56         630
         130          10          84         480
         131          10         168        9600
         132          10         336      110000
         136          11         -36        7800
         137          11          -7       13000
         138          11           0       14000
         139          11           7        3400
         140          11           9        1300
         141          11          14         340
         142          11          20        1000
         143          11          28         150
         144          11          57         240
         145          11          84         540
         146          11         126         170
         150          12         -33      290000
         151          12          -7      600000
         152          12           0      610000
         153          12           2      860000
         154          12           8       47000
         155          12          10       33000
         156          12          15       14000
         157          12          21        9500
         158          12          28        8900
         159          12          59        2200
         160          12          85         720
         161          12         168         110
         162          12         329         220
         163          13         -35      120000
         164          13          -7      250000
         165          13           0      340000
         166          13           2      170000
         167          13           6       21000
         168          13           9        6900
         169          13          14        1700
         170          13          21        1400
         171          13          28         730
         172          13          56          50
         173          13          84          50
         174          13         168          50
         175          13         336          50
         176          14         -35       39000
         177          14          -7      320000
         179          14           2      320000
         180          14           8       67000
         181          14          10       37000
         183          14          21       11000
         184          14          28       10000
         185          14          56        5100
         186          14          79        1100
         187          15         -40      180000
         188          15          -7      100000
         189          15           0      180000
         190          15           2      190000
         191          15           7       18000
         192          15          10        4600
         193          15          21        3000
         194          15          28        2300
         195          15          84       35000
         196          15         169       91000
         197          15         217      100000
         198          16         -27       16000
         199          16          -7       72000
         200          16           0       57000
         201          16           2       39000
         202          16           6       26000
         203          16           9        7300
         204          16          13         620
         205          16          21        1700
         206          16          29         300
         207          16          56         470
         208          16          84         150
         209          16         168         890
         210          16         196        4400
         211          17         -33       53000
         212          17          -7       86000
         213          17           0       86000
         214          17           2      330000
         215          17           6       10000
         216          17           9        3500
         217          17          13         340
         218          17          21         520
         219          17          29         460
         220          17          56         280
         221          17          84          50
         222          17         168       22000
         223          17         413       86000
         224          18         -29       25000
         225          18          -7       19000
         226          18           0       20000
         227          18           2       25000
         228          18           6        5800
         229          18           9        4600
         230          18          14         970
         231          18          21         540
         232          18          29         520
         233          18          56         420
         234          18          84         170
         235          18         168         250
         236          18         336          50
         237          19         -46          50
         238          19          -7       13000
         239          19           0       11000
         240          19           2       35000
         241          19           6        2500
         242          19          10         800
         243          19          13         810
         244          19          20        1200
         245          19          28         360
         246          19          59         230
         247          19          84          50
         248          19         168         290
         249          19         252          50
         250          19         336          50
         251          20          -7      860000
         252          20           0      280000
         253          20           2      960000
         254          20           6      120000
         255          20           9       16000
         256          20          13        5300
         257          20          20        2400
         258          20          28         960
         259          20          58         250
         260          20          84        2700
         261          20         182        8600
         262          20         357       47000
         263          21          -7      170000
         264          21           0      130000
         265          21           3       75000
         266          21           6       28000
         267          21           9        8400
         268          21          13        2300
         269          21          21        1200
         270          21          29        1300
         271          21          56         710
         272          21          84        1300
         273          21         168        1600
         274          21         259          50
         275          21         337          50
         276          22         -33      110000
         277          22          -7      130000
         278          22           0      300000
         279          22           2      100000
         280          22           6       62000
         281          22           9        4800
         282          22          13        3200
         283          22          21        1400
         284          22          28         990
         285          22          63         300
         286          22          84         160
         287          22         168         550
         288          22         336          50
         289          23         -36       65000
         290          23          -7       90000
         291          23           0       85000
         292          23           2       75000
         293          23           7        5300
         294          23          10        7200
         295          23          13        5700
         296          23          21       43000
         297          23          28       19000
         298          23          65       70000
         299          23          98       42000
         300          23         266        6900
         301          24          -7      140000
         302          24           0       69000
         303          24           2       41000
         304          24           7        6900
         305          24           9       11000
         306          24          14        3300
         307          24          20        1900
         308          24          28        1300
         309          24          56          50
         310          24          84          50
         311          24         175         670
         312          24         343        5500
         313          25          -8      110000
         314          25           0      160000
         315          25           2      130000
         316          25           5       57000
         317          25           8       10000
         318          25          12       24000
         319          25          19        1700
         320          25          28        1300
         321          25          65         340
         322          25          84         600
         323          25         174        8600
         324          25         335         590
         325          26         -36       29000
         326          26          -7       56000
         327          26           0       36000
         328          26           2       64000
         329          26           7        9700
         330          26          10        4500
         331          26          13        4400
         332          26          31         990
         333          26          59         480
         334          26          77         240
         335          26         154          50
         336          26         321          50
         337          27         -33       93000
         338          27          -7      170000
         339          27           0      130000
         340          27           2      260000
         341          27           6       71000
         342          27           9       25000
         343          27          13        8300
         344          27          20       13000
         345          27          28        2900
         346          27          56         350
         347          27          77          50
         348          27         161          50
         349          27         316          50
         350          28         -56       99000
         351          28          -9      150000
         352          28          -1      160000
         353          28           4      140000
         354          28           7      110000
         355          28          11       12000
         356          28          18        7800
         357          28          33       30000
         358          28          55        5100
         359          28         103      130000
         360          28         187      140000
         361          28         342      170000
         362          29         -35        1900
         363          29          -7        7900
         364          29           0        9900
         365          29           6        3300
         366          29          10         430
         367          29          14        4700
         368          29          16         610
         369          29          20        2700
         370          29          28        4500
         371          29          56        1140
         372          29          84        2900
         373          29         161        1900
         374          29         336       17000
         375          30         -42       29000
         376          30          -7       38000
         377          30           0       29820
         378          30           2       59000
         379          30           6        9700
         380          30          10        2700
         381          30          13        1700
         382          30          20         810
         383          30          28         310
         384          30          56         200
         385          30          84          50
         386          30         162          50
         387          30         343          50
         388          31         -41       28000
         389          31          -6       57000
         390          31           0       68000
         391          31           2       65000
         392          31           5       29000
         393          31           8       10000
         394          31          12        3800
         395          31          19        2600
         396          31          28        1400
         397          31          56         280
         398          31          84          50
         399          31         174          50
         400          31         336        1400
         401          32         -47      120000
         402          32          -7      200000
         403          32           0      110000
         404          32           2      140000
         405          32           7        9500
         406          32           9        6900
         407          32          14        3100
         408          32          21        1700
         409          32          28        1200
         410          32          42         630
         411          32          77          50
         412          32         161          50
         413          32         329       58000
         414          33          -7         380
         415          33           0         280
         416          33           2         170
         417          33           6         160
         418          33          16          50
         419          33          21          50
         420          33          27          50
         421          33          57          50
         422          33          77          50
         423          33         174         210
         424          33         344          50
         425          34         -35       14000
         426          34          -7       25000
         427          34           0       20000
         428          34           2       19000
         429          34           7        2200
         430          34           9        1100
         431          34          15        2000
         432          34          21         710
         433          34          28        1400
         434          34          57          50
         435          34          85          50
         436          34         169          50
         437          34         337        8500
         438          35         -24      890000
         439          35          -7      720000
         440          35           0      810000
         441          35           2     1600000
         442          35           7      170000
         443          35          10       67000
         444          35          16       29000
         445          35          22        8800
         446          35          29        5300
         447          35          59         690
         448          35          85        1000
         449          35         169       89000
         450          36         -14       54000
         451          36          -8       62000
         452          36           0       69000
         453          36           2       43000
         454          36           6       12000
         455          36           9        4200
         456          36          13        4400
         457          36          20        1500
         458          36          27         790
         459          36          57         820
         460          36          77          50
         461          36         175          50
         462          36         351          50
         463          37         -33       75000
         464          37          -7       13000
         465          37           0      240000
         466          37           2      270000
         467          37           7       11000
         468          37           9        5400
         469          37          14        1100
         470          37          21        1300
         471          37          28         540
         472          37          58         160
         473          37          84         150
         474          38         -35       97000
         475          38          -7     7000000
         476          38           0     1200000
         477          38           2     1100000
         478          38           7      170000
         479          38           9       80000
         480          38          14       20000
         481          38          21       26000
         482          38          27       33000
         483          38          57        4400
         484          38          90         900
         485          39         -39      130000
         486          39          -7       58000
         487          39           0      190000
         488          39           2       79000
         489          39           7       13000
         490          39          10        4400
         491          39          14         930
         492          39          22         280
         493          39          29          50
         494          39          57          50
         495          39          86          50
         496          39         169          50
         497          39         338          50
         498          40         -36      120000
         499          40          -7      220000
         500          40           0      320000
         501          40           2      450000
         502          40           7       56000
         503          40          12       37000
         504          40          16        6400
         505          40          22        8700
         506          40          29        2000
         507          40          57        4000
         508          40          84         450
         509          40         174          50
         510          40         344          50
         511          41         -35         460
         512          41          -7       38000
         513          41           0       12000
         514          41           2       47000
         515          41           7        1900
         516          41           9         530
         517          41          14         270
         518          41          21         170
         519          41          28         280
         520          41          56          50
         521          41          84          50
         522          41         168          50
         523          41         336          50
         524          42         -41      120000
         525          42          -7      430000
         526          42           0      570000
         527          42           2      110000
         528          42           6       16000
         529          42           8        5300
         530          42          13        2800
         531          42          21        1300
         532          42          27         520
         533          42          51         110
         534          42          77          50
         535          42         125      110000
         536          43         -35       13000
         537          43          -7      160000
         538          43           0      150000
         539          43           2       99000
         540          43           8        3300
         541          43          10        4400
         542          43          16        1500
         543          43          21         700
         544          43          37         520
         545          43          57         800
         546          43          83        4100
         547          44         -35       44000
         548          44          -7       76000
         549          44           0      270000
         550          44           2      260000
         551          44           7       35000
         552          44          10        9900
         553          44          14        2200
         554          44          21        2800
         555          44          28        1200
         556          44          57       11000
         557          44          85          50
         558          44          99          50
         559          45         -39       33000
         560          45          -7       42000
         561          45           0       96000
         562          45           2      110000
         563          45           7        7900
         564          45          10        1400
         565          45          14        1500
         566          45          21        1000
         567          45          29        2900
         568          45          57         190
         569          45          85          50
         570          45         170          50
         571          45         339          50
         572          46         -40      110000
         573          46          -7      120000
         574          46           0       71000
         575          46           2      100000
        576          46           7       34000
         577          46          10       14000
         578          46          15        3600
         579          46          22         310
         580          46          28        1100
         581          46          58         750
         582          46          86         450
         583          46         171         450
         584          46         339       20000
         591          47         -36        5400
         592          47           0      190000
         593          47           2      180000
         594          47           7      120000
         595          47          12       30000
         596          47          14       17000
         597          47          21        7900
         598          47          27        3100
         599          47          55        1400
         600          47          90         120
         601          47         168          50
         602          47         336          50
         603          48         -28      110000
         604          48          -7      150000
         605          48           0       55000
         606          48           2       97142
         607          48           7        6900
         608          48          10        1500
         609          48          14         620
         610          48          21         900
         611          48          28         420
         612          48          52       68000
         613          48          78      110000
         614          48         162       83000
         615          48         330      280000